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| 知事公室 | 企画部 | 環境生活部 | 福祉保健部 |
| 秘書課 広報課 基地対策課 返還問題対策課 防災危機管理課 |
情報政策課 地域・離島課 市町村課 |
環境政策課
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福祉・援護課 高齢者福祉介護課 青少年・児童家庭課 障害保健福祉課
国民健康保険課 薬務疾病対策課 |
| 総務部 | |||
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人事課
行政改革推進課 職員厚生課 （職員健康管理センター） 財政課 税務課
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流通政策課
農政経済課 営農支援課 園芸振興課 糖業農産課 畜産課 村づくり計画課 農地水利課 農村整備課 森林緑地課 水産課
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産業政策課 新産業振興課 商工振興課 経営金融課 企業立地推進課 情報産業振興課 雇用政策課 労政能力開発課 |
海岸防災課 港湾課 空港課
下水道課 建築指導課 住宅課 施設建築課 新石垣空港課
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会計課 |
| 文化観光スポーツ部 | |||
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各種委員会
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